Зачем вымачивать? Не понимаю.
После использования аэрографа нужно просто промыть очистителем. Изначально выдуваете всю краску куда-нибудь, потом протираете безворсовой тряпочкой бачок, далее заливаете очиститель немного, закрываете сопло тряпочкой и нажимаете на тригер. Будет булькать. Потом выдуваете всю эту каку. Так пару раз. Можно ватной палочкой бачок внутри прочистить. Это для перехода от одной краски к другой, от светлого к тёмному. Если завершили, то нужно сделать тоже самое, только ещё вынуть иглу и протереть её, прочистить бачок изнутри тряпочкой. В идеале после завершения и прочистки растворами смазать специальным маслом, совсем немного для профилактика.

В случае если прокладки в аэре не тефлоновые, то со временем их придётся поменять, они сохнут и ломаются. Всё зависит от того какими растворами моете. Очиститель от Тамии дорогой и вонючий, многое можно прочистить изопропинолом, он продаётся в радиомагазинах, стоит литр 400 рублей, в интернете за 5 литров можно отдать 800 руб. Он и прокладки не ест и запах спирта.