По большей части также, как и снаружи. Есть фото с U-505, не шнелльбот, но Кригсмарине. На второй фотке уже бот, там все нормально видно. Видел снимок, там действительно щит снутри черный, но это какая-то самодеятельность. Хотя, сами орудия на шнелльботах черные или вороненые

Судя по фотографиям станина окрашивалась в цвет, скажем так, надстройки. Не бронированного колпка, а именно той небольшой надстройки посредине   корпуса. Так вот похоже что на S-100  она окрашивалась не в основной бело-серый, а в серый, немного светлее чем палуба, но темнее чем борта.
На ваших фотографиях S-38. Вполне возможно, что четких иструкций на этот счет не было, и красили как командир катера или флотилии сказал.

Думаю, что у немцев все же не было проблем с краской до середины 44го.
В пользу много цветности говорят след фотографии, и схема окраски из Squadron-а. Хотя, наверняка что-то утверждать
нельзя.